Las principales diferencias entre FAT32 y NTFS radican en compatibilidad, límites de tamaño y características avanzadas.
FAT32 es ideal para dispositivos portátiles por su amplia compatibilidad, mientras que NTFS destaca en entornos Windows por su robustez y seguridad.

Comparación clave

Cuándo usar cada uno

FAT32 se recomienda para USB, tarjetas SD o multi-plataforma, ya que evita problemas de compatibilidad, aunque desperdicia espacio con clústeres grandes.
NTFS es preferible para discos internos/externos grandes en Windows, ofreciendo mejor rendimiento, seguridad y manejo de archivos voluminosos como videos HD.
En forensics o seguridad (relevante para tu perfil), NTFS facilita análisis por su journaling y metadatos ricos.​